Ha studiato alla Facoltà Le Saulchoir con maestri come Congar, Chenu e Dumont. Membro del Centro Istina per lo sviluppo dell’ecumenismo cattolico, la sua esperienza in quell’ambito lo condusse a partecipare ai lavori del Concilio Vaticano II a partire dal secondo periodo. Fondatore e direttore dell’Istituto Superiore di Studi Ecumenici dell’Institut Catholique di Parigi, è stato membro della Commissione Teologica Internazionale e segretario speciale dell’Assemblea del Sinodo dei Vescovi sul sacerdozio nel 1971. Amico di Henri de Lubac, Hans Urs von Balthasar, Joseph Ratzinger, per affrontare la crisi degli anni ’70 il p. Le Guillou propone il recupero della lettura ermeneutica della tradizione cattolica in volumi come Il mistero del Padre e L’Innocente.